队的又一项历史纪录，并且以56胜26负的常规赛战绩连续第二年赢得中部分区冠军。
主教练大鸟伯德在执教了三个异常成功的赛季之后宣布退休。而另一位nba历史上的传奇人物伊赛亚?托马斯，接过了大鸟伯德手中的教鞭。3月30日步行者队客场与凯尔特人进行季后赛席位争夺战，在此之前他们还落后凯尔特人一场。本场比赛步行者队92-87取胜，在剩下的11场比赛中取得9场胜利，其中包括一个七连胜。最后步行者队在12个赛季中第11次杀入季后赛。季后赛在第一场客场比赛中，米勒时刻再现：比赛结束前2.9秒米勒使出杀手锏，三分中的，以1分的优势79-78战胜76人。米勒在后面三场比赛平均每场下36.0分，但最终三连败被76人队以总比分1比3淘汰。球队大换血中段步行者队变得更加年轻。交易之前，步行者队战绩不佳，26胜27负即将无缘季后赛。球队用杰伦.罗斯、特拉维斯?贝斯特和一个二轮选秀权从芝加哥公牛队换来了布拉德?米勒、罗恩?阿泰斯特、凯文?奥利和罗恩?莫瑟。交易之后步行者取得16胜13负，包括最后5场比赛全胜，并排名第八在13年中第12次打入季后赛。季后赛首轮的对手是新泽西网队，新泽西网队淘汰对手并最终取得东部赛区总冠军。在取得了球队有史以来最好的开局（13胜2负）之后，步行者因为种种原因未能将良好的势头保持下去。尽管最终48胜34负的常规赛成绩还要好于上个赛季，但被凯尔特人队淘汰。在全明星赛之前步行者队的战绩（34胜15负）排在东部第一。在全明星赛结束后的三场联赛中获胜之后，步行者队的战绩提高到37胜15负。但此后30场比赛取得了11胜19负。比之前的一系列大动作使得球队迎来了历史上最为丰收的一个赛季。大鸟伯德回归，任俱乐部主席。大鸟解雇了主帅以赛亚.托马斯，里克.卡莱尔接任。球队主心骨小奥尼尔和雷吉?米勒相继续约。步行者队在常规赛季取得61胜21负的nba最好成绩，也创下了球队历史上的胜率新纪录。季后赛首轮步行者队横扫波士顿凯尔特人。接着总比分4比2淘汰劲旅迈阿密热队，11年中第6次杀入东部赛区总决赛。在决赛中他们总比分2比4不敌底特律活塞。2004-05赛季，基本保持原有阵容的步行者队原本有希望再次冲冠，但2004年11月19日，发生了臭名昭著的“奥本山宫群殴事件”。该事件中，共有9名球员得到了总计143场的禁赛处罚，其中事件的头号人物阿泰斯特更是被剥夺了此赛季剩余比赛的参赛资格。事件使球队元气大伤，常规赛结束时仅以44胜38负名列东部第六。在季后赛首*战7场淘汰凯尔特人队后，步行者队在东部半决赛再遇活塞，并同样以2：4落败。赛季结束后，球队的功勋球员雷吉-米勒宣布退役。随着米勒退役后，步行者队继续以小奥尼尔为核心，但以阿泰斯特为首的一批猛将相继离开球队。受伤然后成为主要因素，迫使瑞克?卡莱尔使用31种不同的阵容，用14名球员。小奥尼尔错过了31场比赛。吉迈尔?廷斯利因脚和踝关节的问题错过了40场。但步行者进入了季后赛，这也是连续第九年进入季后赛，季后赛在首轮就已2：4负于篮网。2006-2007的休赛期，步行者送出安东尼?约翰逊、波拉德、克罗希尔、乔纳森?本德尔、斯托亚科维奇及弗雷德?琼斯，补进攻守能力都有一定水平的丹尼尔斯，找回曾在步行者队称职扮演第六人角色的哈灵顿。但这些改变并没有给球队带来胜利，球队滑落到11连败，最终35胜47负无缘季后赛，这是他们没有进入季后赛10年来的第一次。
2007-2008赛季开始前主帅卡莱尔也因执教战绩不佳而下岗。新任主帅吉姆?奥布莱恩继续带领球队，但球队依旧存在着老问题，小奥尼尔、贾马尔?汀斯利因受伤分
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